Река Чуя берёт начало в болотистой местности на западных склонах хребта Хихачева и северных склонах хребта Сайлюгем, соедниясь в единое русло в Чуйской степи. Далее протекает по Курайской степи и затем в горах, между Северо-Чуйским и Айгулакским хребтами. Через 281 км от своего истока впадает в реку Катунь. Площадь бассейна — 11200 км 2.
Вдоль реки проходит федеральная трасса M-52 «Чуйский тракт». На реке Чуя расположены населённые пункты Кош-Агач, Курай, Акташ и др.
Автомобильная дорога Новосибирск - Бийск - Ташанта (трасса М52) является главной транспортной артерией Алтая. Участок от Бийска до Ташанты носит название Чуйский тракт. Официально Чуйский тракт начинается у моста через реку Бию в городе Бийске, проходит через Алтайский край (77 км) и большей частью находится в Республике Алтай (540 км), заканчивается у границы с Монголией.
Семинский перевал - популярное место среди опытных туристов и просто отдыхающих. Старое алтайское название Семинского перевала - "Дьал-Менку". Перевал является самой высокой точкой на Чуйском тракте. Его высота равна почти два километра над уровнем моря. Подъем на Семинский перевал имеет длину 9 км, а спуск 11 км.
Перевал Чике-Таман расположен на знаменитом Чуйском тракте. Высота перевала Чике-Таман составляет 1460 м (то есть, не самый высокий на Алтае; он занимает второе место после Семинского), однако из-за своей крутизны он кажется значительно более высоким. И безусловно, Чике Таман — один из самых красивых перевалов Алтая. У тех, кто проезжает по перевалу впервые, от крутизны подъемов, резко петляющей дороги, крутых обрывов по сторонам и открывающихся горных панорам просто захватывает дух! Но, несмотря на всю свою зрелищность, "Чике-Таман" происходит от алтайских "Чике" - прямая, "таман" - подошва.
“Красные Ворота” расположены в нескольких километрах от села Акташ - по трассе Акташ-Усть-Улаган. Дорога, пересекая по мостику реку Чибитку, проходит между высоких скал с ярко-выраженным красноватым оттенком. Это место носит название “Красные Ворота” и входит в число памятников природы Республики Алтай. Проход в скалах был пробит при строительстве дороги.
Долина реки Чуя.
Мертвое озеро находится в Улаганском районе Республики Алтай, в долине реки Чибитка рядом с трассой Акташ-Усть-Улаган,
слева от дороги в нескольких километрах после Красных ворот. Оно является искусственным. Настоящее название озера – Чейбеккель.